Tous les personnages du jeu se débloquent uniquement à travers le mode mission.
– Ukon : Terminé 5 missions
– Tayuya : Terminé 10 missions
– Iruka : Terminé 15 missions
– Mizuki : Terminé 20 missions
– Akamaru : Terminé 25 missions
– Kimimaro : Terminé 30 missions
– Karasu : Terminé 35 missions
– Haku : Terminé 40 missions
– Zabuza : Terminé 45 missions
– Anko : Terminé 50 missions
– Itachi : Terminé 55 missions
– Orochimaru : Terminé 65 missions
– Tsunade : Terminé 75 missions
– 3eme Hokage : Terminé 85 missions
– Hinata éveillée : Terminé 100 missions
– Sasuke CS2 : Terminé 120 missions
Les personnages suivants se débloquent au cours du mode "Meilleur ennemie", c’est à dire quand un personnage apparait aléatoirement. Pour débloquer le personnage en question, vous devez le battre sans utiliser un seul continue.
– Kisame : meilleur ennemie Gai dans le Rang S
– Kabuto : meilleur ennemie Tsunade dans le Rang S
– Naruto Kyubi : meilleur ennemie Sasuke CS2 dans le Rang S